广州市药品检验所成立于1953年11月，是国家卫生部最早授权的口岸药品检验所之一。2004年1月再次被国家食品药品监督管理局授权为口岸药品检验所，并且规定首次进口的药品仅允许由北京、上海、广州三个口岸进口，指定由中检所、北京所、上海所、广州所等四个药品检验所检验。2003年12月香港特区卫生署中医药管理委员会认定本所为可从事香港中成药注册检验的国内十五个药品检验所之一。本所1991年首次通过广东省计量技术监督局认证，取得“计量认证合格证”，并于2001年通过第二次认证复查。1997年1月通过卫生部实验室认证。2004年5月通过中国实验室认可委现场评审，同年7月取得中国实验室认可委员会认可证书。
　　药品检验所内设化学室、中药室、抗生素室、标准研究室、生测室、技术室、质管科七个业务科室，办公室、党办、总务科、财务科四个行政管理科室和药物研究中心。广州市药品不良反应监测中心与广州市药品检验所合署办公（一个机构，两块牌子）。全所共有职工131人，其中专业技术人员112人，具有高级专业技术职务资格46人，博士学位3人，硕士学位12人，分布在所内各检验科室和管理部门。
　　全所拥有实验办公用房8560m²，配备各类常规检验仪器、设备共566台。能开展化学药品、生化药品、抗生素药品、中成药、中药材的检验以及有关药品质量、药品标准、药品检验技术的科研工作。是国内具有一定规模的药检机构。
　　在药品标准工作方面，广州市药检所先后参加了“广州市药品标准”、“广东省药品标准”的起草、修订、审核工作，又多次参予“中华人民共和国药典”1977、1985、1990、1995、2000、2005年版起草复核和修订工作，参予卫生部和国家药品监督管理局颁布的药品标准修订工作。
　　在药品监督检验工作方面，本所承担辖区内药品的监督抽验工作，并派员参加“药品生产质量管理规范”起草工作，多次参加全国性药品监督检查。
　　在药检科研方面，本所的薄层色谱最佳化研究在全国处于领先地位，广泛应用于中药材及其制剂质量标准制订及检验方法研究。本所历年来获得全国科学大会、国家科委奖项达42项，中药检测研究室（原中药二室）在1996年9月入选广东省“五个一科教兴医工程”重点专科。
　　广州市药检所先后有四人被卫生部聘为药典委员会委员；六人被卫生部聘为进口药品专家咨询委员会委员；二人被国家药品监督管理局聘为新药审评专家；一人被卫生部聘为中药保护品种审评委员会委员；一人被美国药典会聘为专家委员会委员；一人被世界卫生组织聘为国际药典和药品专家顾问；七人被广州中医药大学和广东药学院聘为客座教授；有二人享受国务院政府特殊津贴。